Ensuite compilez MPlayer :

./configure
make
make install

A ce point, MPlayer est prêt à fonctionner. Le répertoire $PREFIX/share/mplayer contient le fichier codecs.conf, qui est utilisé pour donner au programme la liste des codecs et de leurs capacités. Ce fichier n'est requis que si vous voulez changer ses propriétés, car le binaire principal en contient une copie interne. Vérifiez si vous avez un codecs.conf dans votre répertoire personnel (~/.mplayer/codecs.conf) provenant d'une ancienne installation de MPlayer, et supprimez-le.

Notez que si vous avez un codecs.conf dans ~/.mplayer/, les fichiers codecs.conf du système ou celui intégré seront complètement ignorés. Ne faites pas cela à moins de vouloir jouer avec le fonctionnement interne de MPlayer car cela peut poser des problèmes. Si vous voulez changer l'ordre de recherche des codecs, utilisez les options -vc, -ac, -vfm, ou -afm soit en ligne de commande soit dans votre fichier de config (voir la page de man).

Les utilisateurs Debian peuvent construire un paquet .deb pour leur propre usage, c'est très simple. Exécutez

fakeroot debian/rules binary

dans le répertoire racine de MPlayer. Voir Création de paquets Debian pour de plus amples instructions.

Regardez toujours le listing généré par ./configure, ainsi que le fichier config.log, ils contiennent des informations sur ce qui sera compilé, et ce qui ne le sera pas. Vous pouvez également consulter les fichiers config.h et config.mak. Si vous avez quelques librairies installées, mais pas détectées par ./configure, alors vérifiez que vous avez les fichiers d'en-tête (généralement les paquets -dev) et que leur version correspond. Le fichier config.log vous dit généralement ce qui manque.

Bien que n'étant pas indispensables, les polices peuvent être installées pour l'affichage de l'OSD, et le support des sous-titres. La méthode recommandée est d'installer un fichier de police TTF et de dire à MPlayer de l'utiliser. Voir la section Sous-titres et OSD pour les détails.